Les infections respiratoires, virales ou bactériennes, représentent une des causes majeures de surconsommation d’antibiotiques. Les techniques de biologie moléculaire et notamment la PCR Multiplex en temps réel permettent une identification rapide et simultanée d’un large éventail de virus, sous types viraux ainsi que de certaines espèces bactériennes. Cette étude vise à étudier l’épidémiologie des agents pathogènes respiratoires en soulignant l’intérêt de la PCR multiplex dans le diagnostic rapide des infections respiratoires virales et bactériennes. Il s’agit d’une étude rétrospective portant sur 27 prélèvements nasopharyngés reçus au laboratoire de bactériologie-virologie du CHU Hassan II de Fès durant une période de 8 mois allant de décembre 2018 jusqu’à juillet 2019. Les prélèvements ont été traités par la technique PCR multiplex type FilmArray panel respiratoire. Le sexe ratio H/F était de 1,7. La moyenne d’âge était de 15,4. Les services demandeurs étaient respectivement : pédiatrie (63%), réanimation (22%) et urgences adultes (15%).Le panel a détecté 16 cas positif, soit un taux de positivité global de 59%. Les virus isolés étaient comme suit : le humain rhinovirus /entérovirus(8), parainfluenza B (7), influenza A (4), adénovirus (3) et enfin coronavirus(1) et virus respiratoire synticial(1). L’utilisation de PCR multiplex type FilmArray panel respiratoire permet d’améliorer le diagnostic étiologique .elle permet aussi une meilleure maitrise du risque infectieux en identifiant les patients sujets à un isolement et en démarrant précocement un traitement antiviral adéquat réduisant de la sorte les prescriptions inappropriées d’antibiothérapie. La rapidité de rendu des résultats offre au clinicien une décision d’hospitalisation mieux documentée et au patient une durée de séjour plus faible. En dépit des vertus de cette technique, un problème d’accessibilité rencontre les cliniciens vu son cout élevé.